球狀蛋白質(zhì)分子中氨基酸緊密接觸對(duì)性質(zhì)的研究

采用CSU軟件(Contacts of structural units),對(duì)61種球狀蛋白質(zhì)分子中氨基酸緊密接觸對(duì)(Residue-residue contact)進(jìn)行了研究.重點(diǎn)研究了不同氨基酸在形成遠(yuǎn)程緊密接觸對(duì)(Long-range contact)和近程緊密接觸對(duì)(Short-range contact)時(shí)的不同能力.發(fā)現(xiàn)氨基酸Leu,Val,Ile,Met,Phe,Tyr,Cys,Trp(疏性氨基酸,H)比較容易形成遠(yuǎn)程緊密接觸對(duì),氨基酸Glu,Gln,Asp,Asn,Lys,Ser,Arg,Pro(親水氨基酸,P)比較難形成遠(yuǎn)程緊密接觸對(duì),而氨基酸Ala,Gly,Thr,His(中性氨基酸,N)在形成遠(yuǎn)程緊密接觸對(duì)時(shí)能力一般.它們平均每個(gè)氨基酸可形成6.03,3.64和4.43個(gè)遠(yuǎn)程緊密接觸對(duì).同時(shí)它們?cè)谛纬山�程緊密接觸對(duì)時(shí)能力非常接近,平均每個(gè)氨基酸可形成的近程緊密接觸對(duì)數(shù)目在2.34～2.85變化,差別非常小.親水氨基酸(P),中性氨基酸(N)和疏水性氨基酸(H)在蛋白質(zhì)分子結(jié)構(gòu)穩(wěn)定性上起著不同的作用.

作 者： 陳進(jìn) 李靖 章林溪 姜舟婷 夏阿根 葉高翔 趙得祿   作者單位： 陳進(jìn),李靖,章林溪,姜舟婷,夏阿根,葉高翔(浙江大學(xué)物理系,杭州,310028)

趙得祿(中國科學(xué)院化學(xué)研究所分子科學(xué)中心,北京,100080) 

刊 名： 高分子學(xué)報(bào)  ISTIC SCI PKU 英文刊名： ACTA POLYMERICA SINICA  年，卷(期)： 2003 ""(2)  分類號(hào)： O6  關(guān)鍵詞： 球狀蛋白質(zhì)   緊密接觸對(duì)   CSU軟件   折疊  

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